【微機自動構建DNA物理圖譜-λDNA及PBR322物理圖譜的構建】杭州大學.pdf

微机自动构DNA物理图谱一入DNA及BR322物理图谱的构建摘要构霆DNA物理图谱是研究DBA基因图谱的基础。传统的方法比较复杂。本文提出了一种较为简便的微机自动构建法。本法利用环状或线状DNA的限制性核酸内切酶的部分酶解及完全酶解片段的长度,构延出相应DNA的物理图谱.本法对于单酶切及双酶切图谱的构均能应用。我们将本法应用于入DNAECoRI及BR322BamHI-BglI 的物理图谱的构延,均得到满意的结果.关键词:入DNA,BR322,DNA物理图谱,计算机应用。

原理如图1所示,限制酶消化DNA时,可以形成完全酶解的各片段,也可以形成部分酶解的各片段。计算完全酶解片段之间的各种组合及其组合长度.将各个组合长度与每个部分酶解片段长度比较,如果一组合长度在某一部分酶解片段长度的误差范围之内,则图下这一组合,否则则排除之.在这些留下的组合中有两种情况.1、如呆只有一个组合长度在某一部分酶解片段长度的误差范围之内,那么这个组合就是DNA部分酶解片段,但这组合中片段的排列还不能确定,利用末端重叠原理,行比较判断而延长所拼凌的DNA物理图谱:2、如果有2个以上组合长度在某间一部分酶解片段长度的误差范围之内,将这些组合与已拼凑的不完全DNA

酶解 B 组合产生及比较①完全酶解牛段之间的各种组合组合 ABC AB AC BC A B 长度③与部分酶解牛段长度相比较,保留相吻合的组合 AC13 BC9 拼接 ACB 图1.