【蛋白质折叠的成分倾向性和MJ相互作用矩阵的模型研究】王建勇.pdf

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南京大学研究生毕业论文中文摘要首页用纸 毕业论文题目:蛋白质折叠的成分倾向性和MJ相互作用矩阵的模型研究 生物物理专业98级硕士生姓名:王建勇 指导教师(姓名、职称):王炜教授 摘要 蛋白质是生命现象的物质基础之一,它不仅是生命结构的重要组成,还参 与了生物体内许许多多重要功能的实现。蛋白质的折叠问题,就是如何由蛋白 质的一级结构形成其高级结构的机制,有人称之为分子生物学中心法则的第二 密码。破解蛋白质折叠的秘密,无论是对于基础理论的研究还是对于人类的生 存,都有着极为重要的意义.天然蛋白质由20种氨基酸构成。第一章前言 什么是蛋白质 蛋白质的折叠问题.第二章 计算机模拟的模型和方法.2 格点模型和相互作用矩阵.2 蒙特卡洛模拟方法和折叠动力学 蛋白质序列设计方法2 热力学量的计算和直方图方法第三章 计算机模拟的结果和讨论3 模型多肽链中氨基酸残基的成分倾向性3 引言3 模型、方法和结果3 讨论3 对MJ相互作用矩阵的分析和讨论3 引言3 模型、方法和结果.3 讨论.前 言 羧基 氨基 R 图2氨基酸分子 不同的氨基酸是根据R基团的不同而加以区别的。根据这20种氨基酸的极性和 带电荷的性质,可以把它们粗略地分为两类:极性氨基酸和非极性氨基酸。有 些氨基酸的侧链含有带电荷的基团或具有显著的电偶极矩,易于与极性溶剂分 子一水分子相互作用,因此被称为极性氨基酸,或亲水性氨基酸,主要包括:苏氨酸(T)、丝氨酸(S)、天门冬酰胺(N)、谷氨酰胺(Q)、天门冬酰酸(D)、谷氨酸(E)、组氨酸(H)、精氨酸(R)、赖氨酸(K)、脯氨酸(P)。
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